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          基爾頓生物科技 JRDUN BIOTECHNOLOGY
          思想留給科學
          實驗服務
          產品名稱:

          甲基化測序

          上市日期:2017-03-29

          一、服務介紹

          DNA甲基化是重要的表觀遺傳學標記信息,獲得全基因組范圍內的C位點的甲基化水平數據,對于表觀遺傳學的時空特異性研究具有重要意義。我們以新一代高通量測序平臺為基礎,結合全基因組Bisulfite處理和生物信息數據分析技術,進行低成本、高效率、高準確度的全基因組DNA甲基化水平圖譜繪制。特定物種的比較高度甲基化修飾模式的分析,必將在表觀基因組學研究中具有里程碑式的意義,并為細胞分化、組織發育等基礎機制研究,以及動植物育種、人類健康與疾病研究奠定基礎。

          二、分析項目

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          標準分析項目

          1) 數據過濾(去除adaptor,低質量的reads等)

          2) 序列比對、覆蓋度統計、測序深度統計

          3) SNP/InDel/CNV/SV變異信息檢測

          4) SNP/InDel/CNV/SV多種數據庫注釋

          分析項目

          1)腫瘤:

          體細胞突變位點篩選;

          基于質譜的 case/control 樣品成對初步鑒定

          成對樣品的Somatic SNV/InDel/CNV檢測、注釋及統計

          成對樣品SNV/InDel的COSMIC 數據庫注釋分析

          成對樣品SNV的保守型預測

          成對樣品SV檢測分析(CREST)及注釋

          影響氨基酸改變的突變基因的 CancerGeneCensus 數據庫注釋分析

          2)復雜疾病研究

          樣本設計以及power計算

          群體SNP 檢測和Genotype 分型檢測

          SNP注釋與統計

          群體SNP 質控

          基于遺傳數據的樣本質控

          基于單個SNP的關聯分析

          重要結論的獲得。


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