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          基爾頓生物科技 JRDUN BIOTECHNOLOGY
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          實驗服務
          產品名稱:

          miRNA測序

          上市日期:2017-03-29

          一、服務介紹
          microRNA(miRNA)是一種大小約21—23個堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發夾結構的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經過Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(雙鏈)但是和siRNA密切相關。microRNA通過和靶基因mRNA堿基配對引導沉默復合體(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻譯,從而在轉錄后水平調控蛋白表達(新發現miRNA也能在轉錄水平調控基因表達)。miRNA在物種進化中相當保守,在動物、植物和真菌等中發現的miRNA表達均有嚴格的組織特異性和時序性。miRNA在細胞生長和發育過程中起多種作用,包括調控發育、分化、凋亡和增殖等。

          目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技術以及第二代測序技術?;诘诙鷾y序技術的miRNA測序,可以一次獲得數百萬條miRNA序列,能夠快速鑒定出不同組織、不同發育階段、不同疾病狀態下已知和未知的miRNA及其表達差異,為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力工具。


          二、分析項目

          標準分析項目

          1) 原始數據質控(去接頭污染,去低質量reads),數據產出統計;

          2) 與參考序列比對;

          3) 小RNA與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、piRNA的比對信息;

          4) 小RNA與miRBase 中指定范圍的已知的 miRNA的比對;

          5) 按照優先級將小RNA進行分類注釋;

          6) 預測新的miRNA;

          7) 差異miRNA分析;

          8) 差異miRNA表達聚類分析;

          9) miRNA靶基因預測分析

          10) 靶基因功能富集分析


          分析項目(以下分析選擇分析結果較好的3~5個)

          靶基因蛋白互作網絡分析

          miRNA功能協同網絡分析

          miRNA通路協同網絡分析

          miRNA共調控網絡分析

          miRNA活性分析

          按照客戶要求對興趣miRNA進行深入分析;

          重要miRNA的功能富集分析;


          三、樣本要求

          RNA樣品總量: ≥3μg

          RNA樣品濃度: ≥200 ng/μL


          四、項目周期

          45個工作日

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